商洛學院堅持以教學為中心，深化教學改革，深入開展教育教學研究與實踐，重視教學內容優化、教學方法改革、實踐教學創新，堅定不移走內涵發展和轉型發展之路，現有應用化學、生物技術、計算機科學與技術、漢語言文學等11個省級一流專業，是陜西省“實踐育人創新創業基地”。近年來，獲批省級一流本科課程28門，省級高校創新創業教育課程6門，省級特色線上課程1門，陜西省普通高等學校優秀教材一等獎1個，二等獎3個，主持陜西高等教育教學改革研究項目34項，教育部產學合作協同育人項目90項。榮獲陜西省人民政府優秀教學成果一等獎6項，二等獎7項，8名教師被授予省級教學名師稱號，在陜西省高等學校青年教師教學技能競賽中2人獲一等獎，2人獲二等獎，4人獲三等獎，在陜西省高等學校課堂教學創新大賽中1人獲一等獎，6人獲二等獎，3人獲三等獎。在“陜西高校思政課教師大練兵”活動中4人獲教學標兵稱號，5人獲教學能手稱號，1人獲教學骨干，目前正在開展合作的校外實習實訓教學基地180余個，化學工程與現代材料學院、生物醫藥與食品工程學院獲批陜西省高等學校創新創業教育改革試點學院（系）建設單位。
學校把立德樹人作為根本目標，秉承“自強不息 止于至善”的大學精神、“尚教為學 踐用至要”的辦學理念和“博聞強志 正道直行”的校訓，堅持不斷優化人才培養方案，創新人才培養模式，注重應用型人才的培養定位與學生的自主學習能力，按“雙四六”人才培養模式調整公共課與專業課、實踐課與理論課的比例，堅持分類培養，鼓勵創新創業，鼓勵學生參加各類課外創新創業實踐活動。
學校堅持“立足商洛，面向地方，服務基層，培養基礎教育、經濟文化與生態文明建設的應用型人才，建設多學科協調發展應用型本科院校”的辦學定位，積極開展“根植地方行動計劃”。學校所有教師進政府、進企事業單位、進社區、進鄉村，深入基層、服務地方，積極開展校地、校企合作，開闊教師視野，提升教師實踐能力，推動“雙師型”教師隊伍建設，提升學校服務區域經濟社會發展的能力，促進學校應用型大學的建設步伐。2016年被國家發改委、教育部、人社部確定為產教融合發展工程應用型高校。
學校深入貫徹落實陜西省建設“一流大學、一流學科、一流學院、一流專業”的實施意見，認真吸取國內外高等教育最新發展成果，全面推進本科教育內涵建設，積極轉型創新，爭創一流應用型本科院校。